民國90年11月，我國檔案中央主管機關「檔案管理局」在「檔案法」通過後正式成立，隸屬於行政院研究發展考核委員會。然而由於檔案管理局負責徵集具 有永久保存價值之國家檔案，「私人文書」部份並未制定相關移轉辦法，因此「私人文書」檔案徵集多為學術研究單位、博物館或圖書館。目前國內收藏家族檔案約略有以下主要單位：
（一）中央研究院臺灣史研究所
（二）國史館臺灣文獻館
臺灣戰後，政府為保存文獻史料，於民國37年成立「臺灣省通志館」，以纂修省志。翌年七月改組為臺灣省文獻委員會，直屬於臺灣省政府，其任務由編纂省 通志擴大到臺灣文獻之採集、整理及編輯。後幾經組織變遷及隸屬更移，民國91年改隸總統府國史館，更名為「國史館臺灣文獻館」。國史館臺灣文獻館組織編制 為三室（會計室、人事室、秘書室）三組（編輯組、整理組、採集組），而三組之一的編輯組負責業務即包含臺灣地區志書纂修、各族群史、家族史、名人傳記等修 纂計劃。
據該組業務同仁口述，針對家族歷史方面，國史館臺灣文獻館曾經接受嘉義賴家、高雄余家、基隆顏家、宜蘭陳家之委託研究案，以及鹿港施世榜家族研究成果。由此可知該單位對於家族檔案蒐藏與整理具備豐富的實務經驗。
（三）宜蘭縣史館
譜系訃聞：自1992年10月縣史館辦理「宜蘭人家譜特展」活動起，開始大量蒐集家譜，目前計四百餘種，包括60多個姓氏的宜蘭人家譜
入藏。而訃聞也是重要的家族史料，可與家譜進行交叉研究
（四）國立臺灣大學圖書館
該館特藏組內蒐藏較為完整之家族檔案資料有鄭華生先生所收藏之「竹塹北門鄭利源號古契書」以及「岸裡大社」文書二部分。
（五）國立臺灣博物館
（六）國立中央圖書館臺灣分館（以下簡稱臺灣分館）
（七）臺北市文獻委員會
臺北市文獻委員會成立於民國41年，初期隸屬臺北市政府，為一級單位。民國62年改隸民政局，民國88年改隸文化局。該會現設有編纂及總務兩組。該會並開放文獻圖書室，加強文獻服務。該館之於家族檔案最大宗為具有一千多冊族譜資料。
（八）私人收藏
臺灣家族檔案整理與研究多由歷史學者主導，因此部份家族檔案多由研究該家族之歷史學者所蒐藏而用於家族史研究，一般並未對外公開，多由學者依據所蒐藏而來之家族檔案，於自行研究後出版圖書、研究計畫提供大眾使用。
http://nccur.lib.nccu.edu.tw/bitstre…/140.119/…/8/015108.pdf 19/40頁
該館特藏組內蒐藏較為完整之家族檔案資料有鄭華生先生所收藏之「竹塹北門鄭利源號古契書」以及「岸裡大社」文書二部分。
（五）國立臺灣博物館
（六）國立中央圖書館臺灣分館（以下簡稱臺灣分館）
（七）臺北市文獻委員會
臺北市文獻委員會成立於民國41年，初期隸屬臺北市政府，為一級單位。民國62年改隸民政局，民國88年改隸文化局。該會現設有編纂及總務兩組。該會並開放文獻圖書室，加強文獻服務。該館之於家族檔案最大宗為具有一千多冊族譜資料。
（八）私人收藏
臺灣家族檔案整理與研究多由歷史學者主導，因此部份家族檔案多由研究該家族之歷史學者所蒐藏而用於家族史研究，一般並未對外公開，多由學者依據所蒐藏而來之家族檔案，於自行研究後出版圖書、研究計畫提供大眾使用。
http://nccur.lib.nccu.edu.tw/bitstre…/140.119/…/8/015108.pdf 19/40頁
